Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNIP2Q9NS61 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP2Q9NS61 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms