Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED4Q9NPJ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED4Q9NPJ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED4Q9NPJ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED4Q9NPJ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms