Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRPV4Q9HBA0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPV4Q9HBA0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPV4Q9HBA0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.4 ms