Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NYXQ9GZU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NYXQ9GZU5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NYXQ9GZU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NYXQ9GZU5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NYXQ9GZU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NYXQ9GZU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NYXQ9GZU5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NYXQ9GZU5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms