Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXQ1Q9C009 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXQ1Q9C009 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXQ1Q9C009 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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