Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
RNF17Q9BXT8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RNF17Q9BXT8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
RNF17Q9BXT8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RNF17Q9BXT8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RNF17Q9BXT8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms