Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C2orf88Q9BSF0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf88Q9BSF0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C2orf88Q9BSF0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms