Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP5Q96PP8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP5Q96PP8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP5Q96PP8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP5Q96PP8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms