Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC115Q96NT0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC115Q96NT0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC115Q96NT0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC115Q96NT0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms