Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED12Q93074 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED12Q93074 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED12Q93074 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MED12Q93074 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED12Q93074 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED12Q93074 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED12Q93074 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MED12Q93074 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED12Q93074 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED12Q93074 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED12Q93074 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED12Q93074 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED12Q93074 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED12Q93074 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED12Q93074 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED12Q93074 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED12Q93074 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED12Q93074 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED12Q93074 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED12Q93074 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED12Q93074 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED12Q93074 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED12Q93074 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED12Q93074 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED12Q93074 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED12Q93074 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED12Q93074 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED12Q93074 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED12Q93074 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED12Q93074 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED12Q93074 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED12Q93074 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED12Q93074 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED12Q93074 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED12Q93074 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED12Q93074 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED12Q93074 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED12Q93074 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MED12Q93074 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED12Q93074 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED12Q93074 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED12Q93074 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED12Q93074 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED12Q93074 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED12Q93074 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED12Q93074 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED12Q93074 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED12Q93074 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED12Q93074 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED12Q93074 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED12Q93074 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED12Q93074 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED12Q93074 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED12Q93074 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED12Q93074 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED12Q93074 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED12Q93074 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED12Q93074 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED12Q93074 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED12Q93074 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED12Q93074 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED12Q93074 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED12Q93074 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED12Q93074 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED12Q93074 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED12Q93074 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED12Q93074 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED12Q93074 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MED12Q93074 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED12Q93074 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED12Q93074 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED12Q93074 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED12Q93074 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED12Q93074 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED12Q93074 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED12Q93074 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED12Q93074 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED12Q93074 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED12Q93074 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED12Q93074 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms