Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDAQ92838 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDAQ92838 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDAQ92838 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDAQ92838 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDAQ92838 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDAQ92838 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDAQ92838 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EDAQ92838 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDAQ92838 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDAQ92838 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EDAQ92838 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDAQ92838 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDAQ92838 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDAQ92838 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDAQ92838 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDAQ92838 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDAQ92838 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDAQ92838 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EDAQ92838 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDAQ92838 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDAQ92838 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDAQ92838 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDAQ92838 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDAQ92838 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDAQ92838 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDAQ92838 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDAQ92838 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDAQ92838 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDAQ92838 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDAQ92838 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDAQ92838 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDAQ92838 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDAQ92838 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDAQ92838 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDAQ92838 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDAQ92838 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDAQ92838 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDAQ92838 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EDAQ92838 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDAQ92838 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDAQ92838 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDAQ92838 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EDAQ92838 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDAQ92838 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDAQ92838 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDAQ92838 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDAQ92838 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDAQ92838 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDAQ92838 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDAQ92838 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDAQ92838 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDAQ92838 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDAQ92838 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDAQ92838 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDAQ92838 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDAQ92838 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDAQ92838 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDAQ92838 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDAQ92838 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDAQ92838 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDAQ92838 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EDAQ92838 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDAQ92838 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDAQ92838 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDAQ92838 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EDAQ92838 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDAQ92838 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDAQ92838 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDAQ92838 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDAQ92838 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDAQ92838 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDAQ92838 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDAQ92838 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDAQ92838 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDAQ92838 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDAQ92838 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDAQ92838 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDAQ92838 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDAQ92838 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDAQ92838 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDAQ92838 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDAQ92838 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDAQ92838 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDAQ92838 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDAQ92838 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDAQ92838 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDAQ92838 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDAQ92838 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDAQ92838 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDAQ92838 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDAQ92838 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDAQ92838 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDAQ92838 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDAQ92838 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDAQ92838 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDAQ92838 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDAQ92838 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDAQ92838 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDAQ92838 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms