Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTPRUQ92729 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRUQ92729 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRUQ92729 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRUQ92729 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRUQ92729 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms