Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGCDQ92629 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGCDQ92629 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGCDQ92629 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCDQ92629 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms