Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SGCDQ92629 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SGCDQ92629 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SGCDQ92629 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SGCDQ92629 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SGCDQ92629 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGCDQ92629 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SGCDQ92629 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SGCDQ92629 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SGCDQ92629 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SGCDQ92629 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SGCDQ92629 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SGCDQ92629 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SGCDQ92629 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SGCDQ92629 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGCDQ92629 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGCDQ92629 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SGCDQ92629 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SGCDQ92629 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SGCDQ92629 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SGCDQ92629 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SGCDQ92629 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGCDQ92629 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGCDQ92629 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SGCDQ92629 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGCDQ92629 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SGCDQ92629 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGCDQ92629 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGCDQ92629 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGCDQ92629 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGCDQ92629 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGCDQ92629 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SGCDQ92629 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGCDQ92629 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGCDQ92629 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGCDQ92629 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGCDQ92629 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGCDQ92629 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGCDQ92629 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGCDQ92629 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGCDQ92629 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGCDQ92629 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGCDQ92629 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGCDQ92629 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGCDQ92629 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGCDQ92629 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGCDQ92629 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGCDQ92629 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGCDQ92629 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGCDQ92629 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGCDQ92629 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGCDQ92629 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGCDQ92629 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGCDQ92629 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGCDQ92629 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGCDQ92629 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGCDQ92629 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGCDQ92629 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGCDQ92629 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SGCDQ92629 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGCDQ92629 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGCDQ92629 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGCDQ92629 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGCDQ92629 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGCDQ92629 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGCDQ92629 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGCDQ92629 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGCDQ92629 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGCDQ92629 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGCDQ92629 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGCDQ92629 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGCDQ92629 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SGCDQ92629 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGCDQ92629 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SGCDQ92629 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SGCDQ92629 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SGCDQ92629 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGCDQ92629 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGCDQ92629 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGCDQ92629 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGCDQ92629 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SGCDQ92629 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SGCDQ92629 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGCDQ92629 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGCDQ92629 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGCDQ92629 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGCDQ92629 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGCDQ92629 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGCDQ92629 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SGCDQ92629 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGCDQ92629 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGCDQ92629 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SGCDQ92629 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGCDQ92629 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGCDQ92629 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGCDQ92629 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SGCDQ92629 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SGCDQ92629 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGCDQ92629 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGCDQ92629 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms