Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEU7

RAPGEF6, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6Q8TEU7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
RAPGEF6Q8TEU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
RAPGEF6Q8TEU7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RAPGEF6Q8TEU7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
RAPGEF6Q8TEU7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.86
RAPGEF6Q8TEU7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
RAPGEF6Q8TEU7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
RAPGEF6Q8TEU7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
RAPGEF6Q8TEU7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
RAPGEF6Q8TEU7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms