Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHDC9Q8NEP7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC9Q8NEP7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KLHDC9Q8NEP7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLHDC9Q8NEP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms