Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G0

ABI3BP, Target of Nesh-SH3, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3BPQ7Z7G0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABI3BPQ7Z7G0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABI3BPQ7Z7G0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABI3BPQ7Z7G0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABI3BPQ7Z7G0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABI3BPQ7Z7G0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABI3BPQ7Z7G0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABI3BPQ7Z7G0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABI3BPQ7Z7G0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABI3BPQ7Z7G0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABI3BPQ7Z7G0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABI3BPQ7Z7G0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms