Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMUB2Q71RG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMUB2Q71RG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMUB2Q71RG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms