Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC181Q5TID7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC181Q5TID7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC181Q5TID7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC181Q5TID7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC181Q5TID7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms