Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYL7

TMEM196, Transmembrane protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM196Q5HYL7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM196Q5HYL7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM196Q5HYL7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM196Q5HYL7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM196Q5HYL7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM196Q5HYL7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM196Q5HYL7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM196Q5HYL7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM196Q5HYL7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM196Q5HYL7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM196Q5HYL7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms