Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TWISTNBQ3B726 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TWISTNBQ3B726 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
TWISTNBQ3B726 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TWISTNBQ3B726 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms