Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TWIST1Q15672 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TWIST1Q15672 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TWIST1Q15672 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TWIST1Q15672 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms