Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TWIST1Q15672 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWIST1Q15672 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWIST1Q15672 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TWIST1Q15672 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TWIST1Q15672 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TWIST1Q15672 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TWIST1Q15672 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TWIST1Q15672 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TWIST1Q15672 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TWIST1Q15672 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWIST1Q15672 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWIST1Q15672 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWIST1Q15672 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWIST1Q15672 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST1Q15672 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWIST1Q15672 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TWIST1Q15672 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TWIST1Q15672 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWIST1Q15672 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWIST1Q15672 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWIST1Q15672 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TWIST1Q15672 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWIST1Q15672 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWIST1Q15672 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TWIST1Q15672 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TWIST1Q15672 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWIST1Q15672 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST1Q15672 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST1Q15672 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST1Q15672 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST1Q15672 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST1Q15672 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TWIST1Q15672 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TWIST1Q15672 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWIST1Q15672 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST1Q15672 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWIST1Q15672 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWIST1Q15672 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TWIST1Q15672 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TWIST1Q15672 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TWIST1Q15672 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWIST1Q15672 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWIST1Q15672 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWIST1Q15672 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWIST1Q15672 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWIST1Q15672 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWIST1Q15672 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TWIST1Q15672 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TWIST1Q15672 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWIST1Q15672 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWIST1Q15672 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST1Q15672 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWIST1Q15672 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWIST1Q15672 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWIST1Q15672 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TWIST1Q15672 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TWIST1Q15672 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TWIST1Q15672 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST1Q15672 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST1Q15672 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST1Q15672 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWIST1Q15672 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWIST1Q15672 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWIST1Q15672 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TWIST1Q15672 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TWIST1Q15672 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TWIST1Q15672 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TWIST1Q15672 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TWIST1Q15672 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TWIST1Q15672 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TWIST1Q15672 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST1Q15672 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TWIST1Q15672 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TWIST1Q15672 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TWIST1Q15672 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TWIST1Q15672 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TWIST1Q15672 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TWIST1Q15672 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST1Q15672 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TWIST1Q15672 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWIST1Q15672 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWIST1Q15672 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWIST1Q15672 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWIST1Q15672 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWIST1Q15672 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWIST1Q15672 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWIST1Q15672 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWIST1Q15672 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWIST1Q15672 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWIST1Q15672 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWIST1Q15672 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TWIST1Q15672 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TWIST1Q15672 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWIST1Q15672 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TWIST1Q15672 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TWIST1Q15672 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWIST1Q15672 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWIST1Q15672 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWIST1Q15672 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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