Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 SEPT2-210ENST00000420786 539 ntTSL 522.6■■□□□ 1.219e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.079e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.919e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.849e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-218ENST00000437066 574 ntTSL 419.73■□□□□ 0.759e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-213ENST00000428282 1005 ntTSL 319.3■□□□□ 0.689e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-242ENST00000492978 775 ntTSL 319.3■□□□□ 0.689e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.219e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.319e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-235ENST00000475823 371 ntTSL 312.39□□□□□ -0.439e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-224ENST00000457335 570 ntTSL 411.39□□□□□ -0.599e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-214ENST00000428524 644 ntTSL 511.24□□□□□ -0.619e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-212ENST00000425899 738 ntTSL 511.05□□□□□ -0.649e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.649e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-230ENST00000467971 571 ntTSL 210.44□□□□□ -0.749e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-202ENST00000366210 672 ntTSL 39.66□□□□□ -0.869e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -19e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-219ENST00000441533 372 ntTSL 58.68□□□□□ -1.029e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-207ENST00000407017 650 ntTSL 48.27□□□□□ -1.099e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-221ENST00000445030 575 ntTSL 38.27□□□□□ -1.099e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-220ENST00000443492 558 ntTSL 56.82□□□□□ -1.329e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-241ENST00000484740 563 ntTSL 36.45□□□□□ -1.389e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-228ENST00000464128 565 ntTSL 46.17□□□□□ -1.429e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-222ENST00000449239 599 ntTSL 25.96□□□□□ -1.469e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-232ENST00000469434 583 ntTSL 34.49□□□□□ -1.699e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 SEPT2-233ENST00000473479 659 ntTSL 24.39□□□□□ -1.719e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.126e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.26e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 RB1CC1-208ENST00000521611 528 ntTSL 524.69■■□□□ 1.544e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.664e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.644e-6■□□□□ 10.7
SAFBQ15424 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.586e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.796e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)17.91■□□□□ 0.466e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.416e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 SEC13-215ENST00000477547 1313 ntTSL 217.53■□□□□ 0.46e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.226e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.146e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.116e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.026e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 SEC13-216ENST00000479868 2374 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -06e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 213.06□□□□□ -0.326e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 C22orf34-206ENST00000444628 453 ntTSL 512.02□□□□□ -0.496e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 511.95□□□□□ -0.56e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 38.01□□□□□ -1.136e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 57.66□□□□□ -1.186e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-7■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-7■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 LINC00470-203ENST00000577867 1211 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.434e-7■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 LINC00470-204ENST00000578835 674 ntTSL 29.14□□□□□ -0.954e-7■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 LINC00470-206ENST00000581212 721 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.564e-7■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 LINC00470-209ENST00000582862 424 ntTSL 1 (best)5.16□□□□□ -1.584e-7■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 LINC00470-202ENST00000577403 251 ntTSL 1 (best)3.39□□□□□ -1.874e-7■□□□□ 10.6
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SAFBQ15424 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 55.65□□□□□ -1.53e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 54.48□□□□□ -1.693e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 54.1□□□□□ -1.753e-6■□□□□ 10.6
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SAFBQ15424 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 324.28■■□□□ 1.481e-8■□□□□ 10.6
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SAFBQ15424 TNS1-204ENST00000413554 1478 ntTSL 516.27■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 516.13■□□□□ 0.171e-8■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 TNS1-210ENST00000446903 2464 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.148e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.121e-8■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-8■□□□□ 10.6
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SAFBQ15424 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-8■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 PDXK-213ENST00000472777 460 ntTSL 512.7□□□□□ -0.381e-8■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 PDXK-216ENST00000481512 583 ntTSL 511.14□□□□□ -0.631e-8■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 TNS1-202ENST00000310858 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.758e-6■□□□□ 10.6
SAFBQ15424 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.774e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.884e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.944e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.984e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.54e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.645e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.045e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 HLF-204ENST00000572002 1251 ntTSL 314.31□□□□□ -0.125e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 HLF-207ENST00000573422 493 ntTSL 412.99□□□□□ -0.335e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 HLF-203ENST00000570962 1310 ntTSL 212.42□□□□□ -0.425e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.675e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 HLF-206ENST00000573020 414 ntTSL 49.66□□□□□ -0.865e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.035e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 HLF-211ENST00000575868 558 ntTSL 44.99□□□□□ -1.615e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 AC005381.1-201ENST00000593065 769 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 311.05□□□□□ -0.646e-6■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.081e-6■□□□□ 10.5
SAFBQ15424 SAFB-204ENST00000586934 995 ntTSL 520.83■□□□□ 0.936e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 SAFB-207ENST00000589863 2708 ntTSL 219.46■□□□□ 0.716e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.386e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.376e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 CEP57-212ENST00000540830 1936 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.356e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.326e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 CEP57-211ENST00000539855 1739 ntTSL 516.92■□□□□ 0.36e-6■□□□□ 10.4
SAFBQ15424 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.136e-6■□□□□ 10.4
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