Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A6Q14031 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A6Q14031 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL4A6Q14031 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A6Q14031 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
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