Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPSQ13938 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPSQ13938 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPSQ13938 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPSQ13938 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPSQ13938 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPSQ13938 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
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