Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CAPSQ13938 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CAPSQ13938 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CAPSQ13938 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CAPSQ13938 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CAPSQ13938 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CAPSQ13938 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CAPSQ13938 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CAPSQ13938 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CAPSQ13938 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CAPSQ13938 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CAPSQ13938 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CAPSQ13938 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CAPSQ13938 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CAPSQ13938 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAPSQ13938 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAPSQ13938 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CAPSQ13938 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAPSQ13938 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CAPSQ13938 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CAPSQ13938 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CAPSQ13938 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CAPSQ13938 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CAPSQ13938 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CAPSQ13938 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CAPSQ13938 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CAPSQ13938 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CAPSQ13938 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAPSQ13938 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CAPSQ13938 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAPSQ13938 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAPSQ13938 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CAPSQ13938 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CAPSQ13938 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CAPSQ13938 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CAPSQ13938 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CAPSQ13938 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CAPSQ13938 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CAPSQ13938 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CAPSQ13938 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAPSQ13938 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAPSQ13938 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAPSQ13938 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CAPSQ13938 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAPSQ13938 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CAPSQ13938 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAPSQ13938 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAPSQ13938 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CAPSQ13938 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAPSQ13938 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CAPSQ13938 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CAPSQ13938 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAPSQ13938 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CAPSQ13938 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAPSQ13938 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAPSQ13938 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAPSQ13938 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAPSQ13938 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CAPSQ13938 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAPSQ13938 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAPSQ13938 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CAPSQ13938 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CAPSQ13938 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CAPSQ13938 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CAPSQ13938 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CAPSQ13938 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAPSQ13938 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CAPSQ13938 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CAPSQ13938 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CAPSQ13938 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CAPSQ13938 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CAPSQ13938 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CAPSQ13938 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CAPSQ13938 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CAPSQ13938 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CAPSQ13938 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CAPSQ13938 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CAPSQ13938 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CAPSQ13938 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CAPSQ13938 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CAPSQ13938 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CAPSQ13938 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CAPSQ13938 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CAPSQ13938 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAPSQ13938 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CAPSQ13938 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CAPSQ13938 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CAPSQ13938 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CAPSQ13938 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CAPSQ13938 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CAPSQ13938 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CAPSQ13938 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CAPSQ13938 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAPSQ13938 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CAPSQ13938 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CAPSQ13938 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CAPSQ13938 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CAPSQ13938 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAPSQ13938 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAPSQ13938 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
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