Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM32Q13049 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM32Q13049 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM32Q13049 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM32Q13049 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM32Q13049 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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