Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LRP1Q07954 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRP1Q07954 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LRP1Q07954 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LRP1Q07954 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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