Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNFAIP2Q03169 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNFAIP2Q03169 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNFAIP2Q03169 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNFAIP2Q03169 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms