Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NTHL1P78549 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NTHL1P78549 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTHL1P78549 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTHL1P78549 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms