Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBG1P69891 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBG1P69891 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HBG1P69891 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBG1P69891 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBG1P69891 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBG1P69891 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBG1P69891 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HBG1P69891 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HBG1P69891 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HBG1P69891 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HBG1P69891 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HBG1P69891 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HBG1P69891 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HBG1P69891 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HBG1P69891 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HBG1P69891 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HBG1P69891 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HBG1P69891 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HBG1P69891 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HBG1P69891 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HBG1P69891 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HBG1P69891 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HBG1P69891 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBG1P69891 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBG1P69891 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBG1P69891 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBG1P69891 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBG1P69891 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBG1P69891 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HBG1P69891 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HBG1P69891 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HBG1P69891 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HBG1P69891 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HBG1P69891 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HBG1P69891 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HBG1P69891 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HBG1P69891 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HBG1P69891 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HBG1P69891 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HBG1P69891 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HBG1P69891 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HBG1P69891 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBG1P69891 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBG1P69891 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBG1P69891 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBG1P69891 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBG1P69891 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBG1P69891 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HBG1P69891 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HBG1P69891 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HBG1P69891 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HBG1P69891 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HBG1P69891 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBG1P69891 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBG1P69891 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBG1P69891 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBG1P69891 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBG1P69891 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBG1P69891 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBG1P69891 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBG1P69891 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HBG1P69891 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HBG1P69891 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HBG1P69891 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HBG1P69891 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBG1P69891 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBG1P69891 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBG1P69891 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBG1P69891 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBG1P69891 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBG1P69891 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms