Protein–RNA interactions for Protein: P49748

ACADVL, Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADVLP49748 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACADVLP49748 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACADVLP49748 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADVLP49748 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms