Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.343e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-220ENST00000530427 560 ntTSL 511.96□□□□□ -0.493e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.53e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.593e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-224ENST00000533127 551 ntTSL 410.88□□□□□ -0.673e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-219ENST00000529907 826 ntTSL 510.88□□□□□ -0.673e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.853e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.933e-12■■■■■ 48.6
GTF2F1P35269 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.289e-8■■■■■ 48.5
GTF2F1P35269 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 531.57■■■□□ 2.649e-8■■■■■ 48.5
GTF2F1P35269 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 321.23■□□□□ 0.999e-8■■■■■ 48.5
GTF2F1P35269 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.849e-8■■■■■ 48.5
GTF2F1P35269 PRPF38B-204ENST00000467302 2043 ntTSL 1 (best)17.43■□□□□ 0.383e-13■■■■■ 48.5
GTF2F1P35269 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.243e-13■■■■■ 48.5
GTF2F1P35269 PRPF38B-201ENST00000370021 3728 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-13■■■■■ 48.5
GTF2F1P35269 PRPF38B-203ENST00000370025 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.553e-13■■■■■ 48.5
GTF2F1P35269 YWHAE-209ENST00000572108 258 ntTSL 311.63□□□□□ -0.556e-16■■■■■ 48.5
GTF2F1P35269 GATD1-210ENST00000529362 578 ntTSL 325.72■■□□□ 1.712e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-213ENST00000532320 1273 ntTSL 1 (best)18.49■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-216ENST00000534603 863 ntTSL 1 (best)17.79■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-209ENST00000528602 569 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-214ENST00000532839 559 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-211ENST00000529966 800 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 GATD1-202ENST00000354286 3973 ntTSL 512.18□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 48.4
GTF2F1P35269 ZNF160-207ENST00000597112 1728 ntTSL 218.68■□□□□ 0.581e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-210ENST00000599637 565 ntTSL 417.27■□□□□ 0.361e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-216ENST00000602095 617 ntTSL 317.09■□□□□ 0.331e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-212ENST00000599980 750 ntTSL 216.02■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-206ENST00000596966 583 ntTSL 315.48■□□□□ 0.071e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-213ENST00000600924 605 ntTSL 412.67□□□□□ -0.381e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-204ENST00000594760 549 ntTSL 410.54□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.761e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-209ENST00000599247 1926 ntTSL 1 (best)8.41□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.241e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.341e-10■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 MEF2A-211ENST00000559903 574 ntTSL 324.11■■□□□ 1.453e-9■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ADGRE5-207ENST00000587535 931 ntTSL 315.13■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ADGRE5-214ENST00000592261 573 ntTSL 414.84□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ADGRE5-211ENST00000591080 554 ntTSL 413.67□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ADGRE5-201ENST00000242786 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ADGRE5-204ENST00000586517 578 ntTSL 412.79□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ADGRE5-209ENST00000587728 587 ntTSL 411.08□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 ADGRE5-208ENST00000587606 572 ntTSL 210.2□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 48.2
GTF2F1P35269 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.72e-10■■■■■ 48.1
GTF2F1P35269 CPE-203ENST00000480404 437 ntTSL 222.12■■□□□ 1.132e-10■■■■■ 48.1
GTF2F1P35269 CPE-205ENST00000513982 564 ntTSL 48.55□□□□□ -1.042e-10■■■■■ 48.1
GTF2F1P35269 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.642e-42■■■■■ 48.1
GTF2F1P35269 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.157e-8■■■■■ 48
GTF2F1P35269 WIPF2-203ENST00000494757 2113 ntTSL 1 (best)25.9■■□□□ 1.742e-13■■■■■ 48
GTF2F1P35269 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.922e-13■■■■■ 48
GTF2F1P35269 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.742e-13■■■■■ 48
GTF2F1P35269 WIPF2-206ENST00000582781 3163 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.62e-13■■■■■ 48
GTF2F1P35269 WIPF2-208ENST00000583268 581 ntTSL 313.82□□□□□ -0.22e-13■■■■■ 48
GTF2F1P35269 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-13■■■■■ 48
GTF2F1P35269 WIPF2-207ENST00000583130 1529 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-13■■■■■ 48
GTF2F1P35269 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 525.68■■□□□ 1.74e-11■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.934e-11■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.934e-11■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.74e-11■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 DDX17-209ENST00000479734 441 ntTSL 417.4■□□□□ 0.384e-11■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.234e-11■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.064e-11■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 211.54□□□□□ -0.564e-11■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.611e-22■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.571e-22■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.162e-14■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 SDF2L1-202ENST00000466935 601 ntTSL 227.91■■■□□ 2.061e-8■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.851e-8■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.158e-8■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.758e-8■■■■■ 47.9
GTF2F1P35269 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.844e-11■■■■■ 47.8
GTF2F1P35269 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-11■■■■■ 47.8
GTF2F1P35269 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.35e-7■■■■■ 47.8
GTF2F1P35269 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 47.8
GTF2F1P35269 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 320.38■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 47.7
GTF2F1P35269 AL133410.1-202ENST00000431981 472 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.836e-9■■■■■ 47.6
GTF2F1P35269 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 47.6
GTF2F1P35269 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 47.6
GTF2F1P35269 SCNN1D-204ENST00000379101 2268 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 47.6
GTF2F1P35269 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 47.6
GTF2F1P35269 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 47.6
GTF2F1P35269 SCNN1D-208ENST00000470022 645 ntTSL 313.03□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 47.6
GTF2F1P35269 SCNN1D-207ENST00000467651 204 ntTSL 511.69□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 47.6
GTF2F1P35269 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 317.88■□□□□ 0.456e-8■■■■■ 47.5
GTF2F1P35269 DGKH-207ENST00000611224 777 ntTSL 223.97■■□□□ 1.433e-12■■■■■ 47.5
GTF2F1P35269 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.073e-12■■■■■ 47.5
GTF2F1P35269 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.673e-12■■■■■ 47.5
GTF2F1P35269 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.74e-10■■■■■ 47.4
GTF2F1P35269 CDC73-202ENST00000477868 764 ntTSL 311.25□□□□□ -0.614e-10■■■■■ 47.4
GTF2F1P35269 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.154e-10■■■■■ 47.4
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 488.5 ms