Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMB5P28074 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMB5P28074 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB5P28074 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB5P28074 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms