Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA1P25391 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAMA1P25391 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAMA1P25391 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMA1P25391 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms