Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK2P24941 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK2P24941 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK2P24941 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK2P24941 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK2P24941 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK2P24941 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK2P24941 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK2P24941 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK2P24941 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK2P24941 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK2P24941 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK2P24941 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK2P24941 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK2P24941 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK2P24941 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK2P24941 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK2P24941 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK2P24941 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK2P24941 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK2P24941 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK2P24941 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK2P24941 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK2P24941 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK2P24941 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK2P24941 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK2P24941 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK2P24941 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK2P24941 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK2P24941 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK2P24941 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK2P24941 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK2P24941 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK2P24941 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK2P24941 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK2P24941 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK2P24941 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK2P24941 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK2P24941 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK2P24941 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK2P24941 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK2P24941 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK2P24941 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK2P24941 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK2P24941 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK2P24941 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK2P24941 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK2P24941 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK2P24941 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK2P24941 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK2P24941 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK2P24941 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK2P24941 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK2P24941 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK2P24941 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK2P24941 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK2P24941 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK2P24941 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK2P24941 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK2P24941 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK2P24941 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK2P24941 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK2P24941 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK2P24941 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK2P24941 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK2P24941 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK2P24941 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK2P24941 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK2P24941 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK2P24941 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK2P24941 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK2P24941 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK2P24941 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK2P24941 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK2P24941 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK2P24941 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK2P24941 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK2P24941 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK2P24941 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK2P24941 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK2P24941 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK2P24941 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK2P24941 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK2P24941 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK2P24941 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK2P24941 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK2P24941 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK2P24941 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK2P24941 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK2P24941 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK2P24941 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK2P24941 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK2P24941 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK2P24941 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK2P24941 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK2P24941 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK2P24941 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK2P24941 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK2P24941 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK2P24941 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms