Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CXCL2P19875 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL2P19875 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL2P19875 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms