Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
TOP2AP11388 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
TOP2AP11388 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC44.22■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC44.19■■■■■ 4.67
TOP2AP11388 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC44.15■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
TOP2AP11388 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC44.12■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.65
TOP2AP11388 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
TOP2AP11388 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC44■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC44■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
TOP2AP11388 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms