Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IFNA21P01568 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNA21P01568 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IFNA21P01568 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IFNA21P01568 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms