Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFNA21P01568 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNA21P01568 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNA21P01568 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFNA21P01568 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNA21P01568 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNA21P01568 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNA21P01568 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFNA21P01568 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFNA21P01568 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFNA21P01568 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IFNA21P01568 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFNA21P01568 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNA21P01568 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNA21P01568 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFNA21P01568 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNA21P01568 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNA21P01568 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFNA21P01568 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFNA21P01568 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNA21P01568 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNA21P01568 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNA21P01568 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNA21P01568 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNA21P01568 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNA21P01568 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNA21P01568 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNA21P01568 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNA21P01568 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNA21P01568 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNA21P01568 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFNA21P01568 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNA21P01568 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNA21P01568 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNA21P01568 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNA21P01568 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNA21P01568 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNA21P01568 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFNA21P01568 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNA21P01568 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFNA21P01568 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNA21P01568 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNA21P01568 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFNA21P01568 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNA21P01568 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNA21P01568 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNA21P01568 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNA21P01568 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNA21P01568 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNA21P01568 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNA21P01568 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNA21P01568 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNA21P01568 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNA21P01568 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNA21P01568 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA21P01568 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNA21P01568 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNA21P01568 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNA21P01568 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNA21P01568 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNA21P01568 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNA21P01568 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNA21P01568 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNA21P01568 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNA21P01568 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNA21P01568 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNA21P01568 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA21P01568 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA21P01568 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNA21P01568 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA21P01568 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNA21P01568 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNA21P01568 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNA21P01568 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNA21P01568 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNA21P01568 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNA21P01568 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNA21P01568 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNA21P01568 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNA21P01568 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNA21P01568 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNA21P01568 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNA21P01568 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNA21P01568 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNA21P01568 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNA21P01568 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA21P01568 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNA21P01568 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms