Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK1O94907 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK1O94907 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK1O94907 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK1O94907 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK1O94907 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK1O94907 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK1O94907 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK1O94907 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK1O94907 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK1O94907 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK1O94907 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK1O94907 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK1O94907 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK1O94907 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK1O94907 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK1O94907 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK1O94907 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK1O94907 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK1O94907 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK1O94907 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK1O94907 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK1O94907 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK1O94907 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK1O94907 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK1O94907 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK1O94907 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK1O94907 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK1O94907 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK1O94907 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK1O94907 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK1O94907 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DKK1O94907 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK1O94907 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK1O94907 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DKK1O94907 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK1O94907 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK1O94907 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK1O94907 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK1O94907 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK1O94907 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DKK1O94907 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK1O94907 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DKK1O94907 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK1O94907 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK1O94907 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK1O94907 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DKK1O94907 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK1O94907 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK1O94907 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK1O94907 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK1O94907 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DKK1O94907 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK1O94907 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK1O94907 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK1O94907 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK1O94907 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK1O94907 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DKK1O94907 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK1O94907 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK1O94907 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK1O94907 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK1O94907 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK1O94907 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK1O94907 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DKK1O94907 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK1O94907 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK1O94907 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK1O94907 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK1O94907 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DKK1O94907 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DKK1O94907 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK1O94907 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK1O94907 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK1O94907 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK1O94907 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DKK1O94907 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK1O94907 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK1O94907 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK1O94907 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK1O94907 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK1O94907 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK1O94907 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK1O94907 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DKK1O94907 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK1O94907 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK1O94907 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK1O94907 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK1O94907 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK1O94907 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK1O94907 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK1O94907 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DKK1O94907 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK1O94907 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK1O94907 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DKK1O94907 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK1O94907 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK1O94907 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK1O94907 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DKK1O94907 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 920.3 ms