Protein–RNA interactions for Protein: O76009

KRT33A, Keratin, type I cuticular Ha3-I, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33AO76009 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT33AO76009 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT33AO76009 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT33AO76009 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT33AO76009 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms