Protein–RNA interactions for Protein: O76009

KRT33A, Keratin, type I cuticular Ha3-I, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33AO76009 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KRT33AO76009 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT33AO76009 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT33AO76009 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT33AO76009 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KRT33AO76009 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT33AO76009 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT33AO76009 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT33AO76009 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT33AO76009 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT33AO76009 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT33AO76009 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT33AO76009 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT33AO76009 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT33AO76009 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT33AO76009 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT33AO76009 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT33AO76009 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT33AO76009 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT33AO76009 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT33AO76009 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT33AO76009 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT33AO76009 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT33AO76009 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT33AO76009 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT33AO76009 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT33AO76009 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT33AO76009 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT33AO76009 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT33AO76009 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT33AO76009 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT33AO76009 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT33AO76009 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT33AO76009 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT33AO76009 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT33AO76009 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT33AO76009 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT33AO76009 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT33AO76009 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT33AO76009 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT33AO76009 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT33AO76009 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT33AO76009 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT33AO76009 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT33AO76009 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT33AO76009 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT33AO76009 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT33AO76009 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT33AO76009 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT33AO76009 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT33AO76009 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT33AO76009 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT33AO76009 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT33AO76009 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT33AO76009 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT33AO76009 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT33AO76009 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT33AO76009 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT33AO76009 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT33AO76009 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT33AO76009 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT33AO76009 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT33AO76009 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT33AO76009 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT33AO76009 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT33AO76009 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT33AO76009 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT33AO76009 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT33AO76009 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT33AO76009 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT33AO76009 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT33AO76009 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT33AO76009 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT33AO76009 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT33AO76009 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT33AO76009 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT33AO76009 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT33AO76009 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT33AO76009 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT33AO76009 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT33AO76009 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT33AO76009 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT33AO76009 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT33AO76009 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT33AO76009 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT33AO76009 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT33AO76009 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT33AO76009 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT33AO76009 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT33AO76009 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT33AO76009 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT33AO76009 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT33AO76009 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT33AO76009 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT33AO76009 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT33AO76009 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT33AO76009 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT33AO76009 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT33AO76009 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT33AO76009 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms