Protein–RNA interactions for Protein: O60684

KPNA6, Importin subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA6O60684 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KPNA6O60684 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KPNA6O60684 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KPNA6O60684 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KPNA6O60684 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA6O60684 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA6O60684 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA6O60684 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA6O60684 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA6O60684 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA6O60684 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA6O60684 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA6O60684 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KPNA6O60684 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KPNA6O60684 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KPNA6O60684 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KPNA6O60684 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KPNA6O60684 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KPNA6O60684 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KPNA6O60684 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KPNA6O60684 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KPNA6O60684 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KPNA6O60684 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KPNA6O60684 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KPNA6O60684 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KPNA6O60684 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KPNA6O60684 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KPNA6O60684 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KPNA6O60684 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KPNA6O60684 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA6O60684 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA6O60684 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA6O60684 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA6O60684 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KPNA6O60684 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA6O60684 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA6O60684 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA6O60684 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KPNA6O60684 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KPNA6O60684 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KPNA6O60684 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KPNA6O60684 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KPNA6O60684 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KPNA6O60684 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms