Protein–RNA interactions for Protein: O60684

KPNA6, Importin subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA6O60684 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
KPNA6O60684 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
KPNA6O60684 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KPNA6O60684 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KPNA6O60684 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
KPNA6O60684 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KPNA6O60684 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KPNA6O60684 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
KPNA6O60684 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KPNA6O60684 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KPNA6O60684 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KPNA6O60684 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KPNA6O60684 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KPNA6O60684 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KPNA6O60684 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KPNA6O60684 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KPNA6O60684 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KPNA6O60684 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KPNA6O60684 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
KPNA6O60684 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
KPNA6O60684 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KPNA6O60684 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KPNA6O60684 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KPNA6O60684 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KPNA6O60684 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KPNA6O60684 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KPNA6O60684 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KPNA6O60684 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
KPNA6O60684 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KPNA6O60684 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KPNA6O60684 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KPNA6O60684 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KPNA6O60684 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
KPNA6O60684 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KPNA6O60684 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
KPNA6O60684 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
KPNA6O60684 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KPNA6O60684 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KPNA6O60684 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KPNA6O60684 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KPNA6O60684 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KPNA6O60684 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KPNA6O60684 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KPNA6O60684 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KPNA6O60684 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KPNA6O60684 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KPNA6O60684 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KPNA6O60684 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KPNA6O60684 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KPNA6O60684 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KPNA6O60684 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KPNA6O60684 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KPNA6O60684 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KPNA6O60684 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KPNA6O60684 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KPNA6O60684 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KPNA6O60684 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KPNA6O60684 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KPNA6O60684 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KPNA6O60684 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KPNA6O60684 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KPNA6O60684 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KPNA6O60684 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KPNA6O60684 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KPNA6O60684 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KPNA6O60684 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KPNA6O60684 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KPNA6O60684 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KPNA6O60684 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KPNA6O60684 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KPNA6O60684 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KPNA6O60684 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KPNA6O60684 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KPNA6O60684 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KPNA6O60684 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KPNA6O60684 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KPNA6O60684 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KPNA6O60684 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KPNA6O60684 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KPNA6O60684 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KPNA6O60684 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KPNA6O60684 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KPNA6O60684 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KPNA6O60684 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KPNA6O60684 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KPNA6O60684 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KPNA6O60684 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
KPNA6O60684 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
KPNA6O60684 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KPNA6O60684 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KPNA6O60684 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KPNA6O60684 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KPNA6O60684 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KPNA6O60684 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KPNA6O60684 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KPNA6O60684 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KPNA6O60684 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KPNA6O60684 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KPNA6O60684 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
KPNA6O60684 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms