Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8B1O43520 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B1O43520 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP8B1O43520 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP8B1O43520 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms