Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUV39H1O43463 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUV39H1O43463 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUV39H1O43463 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SUV39H1O43463 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUV39H1O43463 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUV39H1O43463 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SUV39H1O43463 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUV39H1O43463 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms