Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VCYO14598 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VCYO14598 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VCYO14598 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VCYO14598 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VCYO14598 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VCYO14598 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VCYO14598 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VCYO14598 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VCYO14598 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VCYO14598 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VCYO14598 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VCYO14598 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VCYO14598 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VCYO14598 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VCYO14598 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VCYO14598 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VCYO14598 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VCYO14598 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VCYO14598 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VCYO14598 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VCYO14598 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VCYO14598 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VCYO14598 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VCYO14598 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VCYO14598 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VCYO14598 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VCYO14598 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VCYO14598 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VCYO14598 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VCYO14598 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VCYO14598 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VCYO14598 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VCYO14598 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VCYO14598 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VCYO14598 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VCYO14598 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VCYO14598 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VCYO14598 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VCYO14598 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VCYO14598 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VCYO14598 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VCYO14598 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VCYO14598 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VCYO14598 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VCYO14598 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VCYO14598 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VCYO14598 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VCYO14598 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VCYO14598 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VCYO14598 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VCYO14598 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VCYO14598 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VCYO14598 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VCYO14598 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VCYO14598 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VCYO14598 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VCYO14598 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VCYO14598 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VCYO14598 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VCYO14598 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VCYO14598 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VCYO14598 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VCYO14598 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VCYO14598 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VCYO14598 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VCYO14598 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VCYO14598 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms