Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMCO2A6NFE2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMCO2A6NFE2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMCO2A6NFE2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMCO2A6NFE2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMCO2A6NFE2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms